Daarnaast is Enthoven lid van de Raad van Bestuur van de University for Peace (UPEACE) en voorzitter van een aantal stichtingen voor duurzaamheid, vredesopvoeding en cultureel erfgoed in Nederland.

Hij was een Research Associate aan Princeton University (1965-1967) en een Research Fellow aan het Nederlands Nationaal Lucht-en Ruimtevaartlaboratorium (1967-1972). In 1972 trad Enthoven trad toe tot het ministerie van Milieu, waar hij milieubescherming en het beleid inzake duurzame ontwikkeling ontwikkelde, als Inspecteur - Generaal Milieubeheer (1980-1988) en directeur-generaal (1988-1994). In 1986 was hij de nationale coördinator voor Nederland 'rampenbestrijding op de kernramp van Tsjernobyl'. Van 1994 tot 1998 was hij directeur-generaal voor Milieuzaken, nucleaire veiligheid en civiele bescherming bij de Europese Commissie. En van 1998-2004 was hij directeur van NIBC Bank in Den Haag.

Marius Enthoven heeft een MSc Luchtvaart-en Ruimtevaarttechniek van de Technische Universiteit Delft.