Mueller is codirecteur van Utrecht University's Centre of Television in Transition. Daarnaast leidt hij het door de EU-gesubsidieerde project EUscreen XL-Creating Online Access to European Television Heritage, waar 32 Europese televisie archieven, software ontwikkelaars en universiteiten samenwerken om het audiovisuele erfgoed online beschikbaar te maken. Mueller is ook betrokken bij het EU/Au-exchange project BorderCrossing: People and Places als programmacoördinator van de UU.

In de westerse wereld besteden mensen gemiddeld evenveel tijd, namelijk zeven uur, aan werken, slapen en media consumptie. Müller is gefascineerd door dit fenomeen. Ook is hij geïnteresseerd in de transformatie van televisie en haar invloed op populaire cultuur, media entertainment en participatie in de digitale media omgeving.