Ten Hagen is geïnteresseerd in de totstandkoming van (wetenschappelijke) kennis. In zijn historische en filosofische onderzoek verkent hij de ontwikkeling van geesteswetenschappen en natuurwetenschappen en de interactie tussen deze onderzoeksgebieden.

In zijn onderwijs stimuleert hij studenten om kritisch na te denken over interdisciplinariteit en begeleidt hij hen bij het uitvoeren van interdisciplinair onderzoek.