Eerder was ze lector Filosofie en Beroepspraktijk aan de Haagse hogeschool en bijzonder hoogleraar Gender en Biomedische Wetenschappen aan de Universiteit van Maastricht. Van 2015 tot 2017 was zij Denker des Vaderlands.

Huijer heeft een groot aantal boeken op haar naam staan, waaronder het in 2016 verschenen Discipline. Overleven in overvloed. 

Huijer studeerde geneeskunde aan de Vrije Universiteit Amsterdam waarna ze in 1984 huisarts werd. Hierna studeerde ze sociale filosofie aan de Universiteit van Amsterdam, waarin ze in 1991 cum laude afstudeerde. Na haar promotie in 1996 over het late werk van de Franse filosoof Foucault (De kunst gewoon te leven. Aids en de bestaansethiek van Foucault) concentreerde ze zich op de filosofie in relatie tot biomedische praktijken. Van 2002 tot 2005 was zij bijzonder hoogleraar op het gebied van gender en biomedische wetenschap.