Van Vliet onderzoekt de impact van wereldwijde veranderingen op de beschikbaarheid en kwaliteit van watervoorraden. Daarbij kijkt ze zowel naar het gebruik van water in verschillende sectoren, bijvoorbeeld voor irrigatie en drinkwater, als naar ecosystemen.

Naast haar werk aan de Universiteit Utrecht is Van Vliet onderzoeker bij de onderzoeksgroep Water Systems and Global Change van Wageningen University.