Bransen doet vooral onderzoek naar kwesties als onderwijs, autonomie, persoonlijke identiteit en zelfkennis.

Naast zijn functie als hoogleraar is hij academisch leider van het Radboud Teaching and Learning Centre, dat het onderwijs probeert te verbeteren met behulp van innovatie en onderzoek.

Bransen schreef meerdere boeken, waaronder Gevormd of vervormd? Een pleidooi voor ander onderwijs (2019). In 2013 publiceerde hij Laat je niets wijsmaken: over de macht van experts en de kracht van gezond verstand, waarmee hij de Socrates wisselbeker won.